Pain/Nagato (Vila Oculta da Chuva)É o líder da Akatsuki, junto com Madara Uchiha fundou a Akatsuki. Todos os 6 corpos de Pain foram derrotados por Naruto Uzumaki, durante a invasão a Konoha. Nagato possui o rin'negan o doujutsu mais poderoso que existe. O Rin'negan tem o poder de controlar todos os elementos e com isso, permite ao usuário utilizar todos os ninjutsus dos seis caminhos, Nagato era capaz de invocar a Gedo Mazo, um monstro capaz de sugar a alma de seus oponentes, através desse a Akatsuki estava sugando o poder dos Bijuus para criar o Jutsu Final. Se auto-nomeava Deus.
Tobi/Madara Uchiha (Vila Oculta da Folha)Junto com Nagato, Madara fundou a Akatsuki. Possui o sharingan mais poderoso que já se viu. Após a falsa morte de Madara, Pain assume a liderança da Akatsuki, mas recebe ordens de Madara secretamente. Depois, ele volta como Tobi usando uma máscara laranja que só se permite ver por um olho. Na Grande Guerra ninja, lutou contra Hashirama Senju que se tornaria o Primeiro Grande Hokage. Madara junto com Hashirama fundou a Aldeia da Folha.Caso necessário utiliza o Eien Magenkyou Sharingan que lhe permite se mover ou teleportar no espaço-tempo. Tem o poder de invocar a Raposa de Nove Caudas.
Seus jutsus consistem em moldar argila nas bocas em suas mãos junto com seu chakra. Tem 4 tipos de chakra (C1,C2,C3 e C4). C1- cria animais que causam explosão pequena. C2- cria um dragão de explosão média que pode lançar bombas C1 pela sua boca.C3- cria uma coruja que após ser aumentada vai em direção ao solo, que causa uma imensa explosão.C4- consiste na criação de um clone de argila,que após ser expandido toma a forma um de Deidara gigante e após explodir vários animais microscópios de argila que penetram no corpo do inimigo e são detonados lá de dentro causando uma explosão a nível celular. Em último caso utiliza um kinjutsu onde ele se transforma em uma bomba, que causa uma explosão a nível nuclear.
Konan (Vila Oculta da Chuva)
É a única mulher da Akatsuki, é braço direito de Pain. Quando criança foi treinada por Jiraiya junto com Nagato e Yahiko. Após a morte de Yahiko prometeu estar sempre com Nagato, e esteve junto a ele até o seu ultimo milésimo de vida. Utiliza jutsus com origame que podem explodir ou podem se envoltar no corpo do inimigo imobilizando-o.
Itachi Uchiha (Vila Oculta da Folha)
Itachi Uchiha entrou na Akatsuki depois da sua ultima missão na Aldeia da Folha, em matar todo o seu clã, quando entrou na Akatsuki teve que ir atrás de Deidara, para trazelo a força para a Akatsuki, Orochimaru tentou pegar seu corpo mais não conseguiu, Itachi fez companhia com Kisame Hoshigaki, foram pegar a Yonbi no Saru(Bijuu de 4 caudas) mais Itachi não lutou com ela, Itachi foi morto pelo seu irmão Sasuke Uchiha.
Kisame Hoshigake (Vila Oculta da Névoa)Kisame é um dos 7 espadachins da Aldeia da Névoa, possui a espada mais poderosa dos outros 6, tem caracteristicas de peixe, possui tanto Chakra, que é chamado de Bijuu sem cauda. É parceiro de Itachi Uchiha e capturou sozinho a Yonbi no Saru(Bijuu de 4 caudas.Sua espada Samehada é recoberta por escamas de tubarão, ela tem a capacidade de absorver o chakra de seus inimigos com apenas um toque no corpo do oponente.
